Perguntas um pouco complicadas... Tentarei responder.
1- Suas coordenadas mostram sua localização atual, é possível vê-las apertando o F3 in-game.
o X é mudado de acordo com que você vai ao Norte/Sul, já o Z é pelo Leste/Oeste, e o Y mostra sua camada (altura) em relação á última camada de Bedrock.
2- Vou lhe passar um tutorial com um bom esquema de tuneis, só ver aqui.
3- Tutorial de em que camada é encontrada em maior quantidade cada minerio, aqui.
