Abre o gerenciador de tarefas e encerra todos os processos que tem vínculo com o AfterFX (Todos que tiverem o nome do programa).
Depois que fizer isso, tenta desinstalar.
Se isso não der certo, reinicia o computador e faz isso de novo.
Poste aqui o resultado.
Estamos analisando seu caso, em breve será postado aqui uma resposta!
Obs: Esta mensagem é automatica.