O jeito mais fácil atualmente para proteger um local sem ser VIP é construindo um porão em baixo da casa (ou construção) totalmente vazio e com 3 blocos de altura, assim, caso alguém tente invadir por baixo, vai ficar preso dentro desse local!
Outra forma é não usar portas, eu acho que existe um Bug onde é possível passar por portas, eu não sei se ainda existe!